蛋白质组学技术平台服务公告

蛋白质组学技术平台是以生物质谱技术为核心，主要应用于蛋白质组学，定量蛋白质组学，蛋白质翻译后修饰，蛋白质与蛋白质相互作用和蛋白质与小分子相互作用等研究领域。平台现拥有电喷雾线性离子阱-静电耦合质谱 (LTQ-Orbitrap，Thermo)、 基质辅助激光解析串联飞行时间质谱 (MALDI- TOF/TOF，ABI 4700)、高效液相色谱 (Michrom MDLC)、生物质谱数据处理服务器 (SageN Sorcerer)、双向电泳系统 (Bio-Rad)、荧光扫描仪 (FuJi FLA-5100)、差异凝胶电泳 (DIGE) 分析系统 (GE DeCyder)、真空干燥仪(Thermo)、冻干机(Christ)等大型仪器。

蛋白质组学技术平台致力于基础研究、应用研究及学术交流。平台的主要职责和功能包括：参与国家重大课题（如973、 863、国家自然科学基金及其他课题等）的科学研究；参与蛋白质组学相关科研课题的合作；负责对研究生进行蛋白质组学相关的课题指导和培训；负责对上海交通大学医学院及其他科研、企事业单位的蛋白样品鉴定。

为规范实验室管理，提高工作效率，提供更优质服务，本平台制定并公示此服务公告，请在送样前仔细阅读注意事项和收费标准，并认真填写《蛋白质组学技术平台委托送样单》。

蛋白质组学技术平台可分析项目主要包括：

(1) 差异样本表达蛋白含量变化分析 (2D-DIGE)；

(2) 纯化蛋白、多肽序列鉴定(TOF/TOF、LTQ-Orbitrap)；

(3) SDS-PAGE、IP样品蛋白鉴定 (TOF/TOF、LTQ-Orbitrap)；

(4) 蛋白质翻译后修饰位点鉴定(LTQ-Orbitrap)及数据分析；

(5) 定量蛋白质组学样品鉴定(LTQ-Orbitrap)及数据分析。

联系人：夏立 汪彤丹 王晓玲

联系电话： 63846590-776404

联系地址：重庆南路280号西2号楼1007室

使用规范：

1. 送样单填写需知：

1. 送样单必须完整填写，不得空栏，如实填写送样个数，所有样品均需注明样品种属、处理方式及简要目地。

2. 经平台负责人审核后的测试费用，必须由课题组长签字认可，所送样品方为有效接收。若无签字，视为无效送样，不予测试。

3. 样品形式包括冻干粉、溶液、切胶后的湿胶、整块胶等形式，可请工作人员协助完成切胶任务。胶块送样请附胶带扫描打印纸张并标记待测样品位置。整胶送样，可自行选择确定切割样品个数。

4. 磷酸化翻译后修饰可提供样品富集及位点鉴定完整流程服务，其他翻译后修饰可提供位点鉴定，但暂不提供样品富集技术支持。

5. 所有定量分析样品（DIGE、 SILAC、ICAT、iTRAQ），请自行购买标记试剂盒，平台工作人员提供相应的技术支持。

2D-DIGE推荐试剂: 试剂盒可做10个样品，有效期3个月。请合理安排样本数据及开启时间。

2. 送样周期

(1) 蛋白质样品需经蛋白质组技术平台工作人员按操作流程处理，包括脱色，皱缩，DTT还原，IAA烷基化，酶切，除杂质、脱盐、真空干燥等步骤，约需一周后方能进入质谱分析仪分析鉴定。

(2) 样品根据送样先后顺序依次进入质谱分析，常规分析周期为一月。如有特殊情况，请向平台负责人申请加急。若遇样品繁多或机器保养，会提前告知，并请大家谅解。

3. 结果提交及复议

(1) 委托送样单经课题组长签字后，一式两份，待样品检测完成，凭委托送样单及转帐支票来领取结果。

(2) 质谱原始谱图及蛋白分析结果在硬盘保存期限为一年。对质谱鉴定结果有异议，建议立即申请复议。

收费标准

1. 交通大学医学院系统以内部优惠价，半价计费。

2. 质谱费用实行按实际走样个数计件收费。

蛋白质组学技术平台委托送样单

上述内容请送样人如实填写

蛋白质组技术平台设备管理员